临床观察发现肥胖妇女常伴有月经失调，表现为月经量由多逐渐减少直至闭经。甚至有些肥胖者不能生育。
　
　　现代医学研究认为，肥胖伴月经失调的妇女往往是由于体内丘脑─垂体─卵巢轴系统功能失调，致体内激素失去平衡，引起其中半数人月经过少或卵巢功能异常。胖人的特点是身体内的脂肪很多，脂肪组织含有芳香化酶和5α-还原酶，前者可以把雄激素转化为雌激素，当芳香化酶含量增加时（如肥胖者），雌激素水平持续升高（而不是正常波动），损害正常的排卵功能。5α-还原酶增多使睾酮转换为双氢睾酮（DHT）增多，DHT生成过多引起多毛症和痤疮。 肥胖对卵巢功能有明显影响，表现为卵泡发育异常、排卵障碍、发育不良等。卵巢发生故障可显著影响月经周期、性功能及生育能力。因此，肥胖者常常不能生育，并容易发生功能性子宫出血或闭经。
　
　　对于肥胖引起的月经失调患者，医生们会让其减去多余的体重，体重减轻后可恢复生殖系统的功能。
　
　　此外人体其他内分泌系统疾病也会引起肥胖与月经失调，如肾上腺皮质功能亢进，甲状腺功能减退等。