少数肛周脓肿用抗生素热水坐浴及局部理疗等可以消散，但多数需要手术治疗，手术有两种方式

　　（一）单纯性脓肿的治疗

　　可在截石位或侧卧下用局麻或腰麻，在脓肿部位做放射状切口，放出脓液后伸入食指探查脓腔大小，分开其间隔。必要时将切口边缘皮肤切开少许以利引流，最后用凡士林纱条放入脓腔做引流。

　　（二）脓腔与肛瘘相通的脓肿

　　可在切开脓肿后用探针仔细检查内口，然后切开瘘管，适当切除皮肤和皮下组织内口周围组织也稍加切除，使引流通畅。如内口较深瘘管通过肛管括约肌，可采用挂线疗法。以上手术优点是脓肿一期治愈不再形成肛瘘。但在急性炎症中，找内口有困难时不应盲目寻找，以免炎症蔓延或形成假道，仅做切开排脓待形成肛瘘后，再做肛瘘手术。二期手术优点是效果准确治愈率高。

　　值得注意的是文献报告肛门周围脓肿单纯切开引流治疗也有些不再复发，如Hanley(1978)报道35%～40%无复发。Scoma(1974)34%无复发Vasilevsky(1984)103例肛门直肠脓肿切开引流治疗，随访1月至9年，括约肌间脓肿无复发83例肛门周围脓肿及9例坐骨直肠窝脓肿，11%发生复发脓肿，37%形成肛瘘因此，一期手术不应作为常规手术，以免影响肛门功能